Документальный фильм «Мастерская» состоит из двух частей. Первая часть повествует о создании «Мастерской первого фильма», которая позднее была названа «Студия первого и экспериментального фильма», начавшей свою работу в 1988 году. Картина рассказывает, с чего начал режиссер Алексей Юрьевич Герман, как собрал студийную команду и нашел молодых талантов. Рассказчиками выступают тогдашние дебютанты студии — сейчас известные режиссеры. Вторая часть посвящена киношколе при студии, набору учеников, их обучению и творческому процессу, а также первым шагам в профессии.