Исаак Шмарук родился 9 (22 августа по новому стилю) 1910 года в Нежине Черниговской губернии. В 1934 году окончил факультет режиссуры киноинститута в Киеве. С 1931 года - ассистент режиссера, второй режиссер, а затем режиссер-постановщик киностудии имени А.П. Довженко. В 1954 году получил номинацию на Гран-при 7-го Каннского кинофестиваля за свой дебютный фильм «Судьба Марины», снятый совместно с Виктором Ивченко (картина стала дебютной для актера Леонида Быкова).
Умер 2 августа 1986 года. Похоронен в Киеве на Байковом кладбище.